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高等植物
| 和名・学名 | 科 目 |
|---|---|
| ミヤコイヌワラビ Athyrium frangulum Tagawa | オシダ科（APG：イワデンダ科） |
| ミヤマスミレ Viola selkirkii Pursh ex Goldie | スミレ科 |
| ミヤマトベラ Euchresta japonica Hook.f. ex Maxim. | マメ科 |
| ミヤマママコナ Melampyrum laxum Miq. var. nikkoense Beauverd | ゴマノハグサ科（APG：ハマウツボ科） |
| メアオスゲ Carex candolleana H.Lév. et Vaniot | カヤツリグサ科 |
| メヤブソテツ Cyrtomium caryotideum （Wall. ex Hook. et Grev.) C.Presl | オシダ科 |
| ヤチマタイカリソウ Epimedium grandiflorum C.Morren var. grandiflorum | メギ科 |
| ヤマイバラ Rosa sambucina Koidz | バラ科 |
| ヤマブキソウ Hylomecon japonica （Thunb.) Prantl et Kündig | ケシ科 |
| ヨコグラヒメワラビ Thelypteris hattorii （H.Itô) Tagawa | オシダ科（APG：ヒメシダ科） |
| ラセンソウ riumfetta japonica Makino | シナノキ科（APG：アオイ科） |
| ワレモコウ Sanguisorba officinalis L. | バラ科 |
コケ類
| 和名・学名 | 科 目 |
|---|---|
| イワダレゴケHylocomium splendens | セン類：イワダレゴケ科 |
| オオミミゴケMeteoriella soluta | セン類：ヒムロゴケ科 |
| コバノホソベリミズゴケSphagnum junghunianum subsp. pseudomolle | セン類：ミズゴケ科 |
| シダレゴヘイゴケPtychanthus striatus | タイ類：クサリゴケ科 |
| タカネシゲリゴケNipponolejeunea subalpina | タイ類：クサリゴケ科 |
| マツムラゴケDuthiella speciosissima | セン類：ムジナゴケ科 |
藻類
| 和名・学名 | 科 目 |
|---|---|
| アオカワモズク Batrchospermum helminthosum Bory | カワモズク科 |
| シャジクモ Chara braunii Gmelin | シャジクモ科 |
| チャイロカワモズク Batrchospermum arcuatum Kylin | カワモズク科 |
地衣類
| 和名・学名 | 科 目 |
|---|---|
| イソカラタチゴケ Ramalina litoralis Asah. | Ramalinaceae カラタチゴケ科 |
| ウスベニヒゲゴケ Usnea mutabilis Stirt. | Paemeliaceae ウメノキゴケ科 |
| ウチキウラミゴケ Nephroma servitianum Gyeln. | Nephromataceae ウラミゴケ科 |
| オリーブゴケ Melanelia olivacea （L.) Essl. | Paemeliaceae ウメノキゴケ科 |
