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高等植物
| 和名・学名 | 科 目 |
|---|---|
| マシカクイ Eleocharis tetraquetra Nees | カヤツリグサ科 |
| マツグミ Taxillus kaempferi （DC.) Danser | ヤドリギ科（APG：オオバヤドリギ科） |
| マツラン Gastrochilus matsuran （Makino) Schltr. | ラン科 |
| マネキグサ Loxocalyx ambiguous （Makino) Makino | シソ科 |
| マメグミ Elaeagnus montana Makino | グミ科 |
| マルバノサワトウガラシ Deinostema adenocaulum （Maxim.) T.Yamaz. | ゴマノハグサ科（APG：オオバコ科） |
| ミアケザサ Sasa miakeana Sad.Suzuki | イネ科 |
| ミクリ Sparganium erectum L. | ミクリ科 |
| ミズタガラシ Cardamine lyrata Bunge | アブラナ科 |
| ミネザサ Sasa minensis Sad.Suzuki | イネ科 |
| ミノボロ Koeleria macrantha （Ledeb.) Schult. et Schult.f. | イネ科 |
| ミミカキグサ Utricularia bifida L. | タヌキモ科 |
| ミヤマコウモリソウ Parasenecio farfarifolius （Siebold et Zucc.) H.Koyama var. acerinus （Makino) H.Koyama | キク科 |
| ミヤマナルコユリ Polygonatum lasianthum Maxim. | ユリ科（APG：ナギイカダ科） |
| ミヤマヌカボ Agrostis flaccid Hack. | イネ科 |
| ミヤマミズ Pilea angulata （Blume) Blume subsp. petiolaris （Siebold et Zucc.) C.J.Chen | イラクサ科 |
| ムカゴニンジン Sium ninsi L. | セリ科 |
| ムヨウラン Lecanorchis japonica Blume | ラン科 |
| モロコシガヤ Sorghum nitidum （Vahl) Pers. var. dichroanthum （Steud.) Ohwi | イネ科 |
| モロコシソウ Lysimachia sikokiana Miq. | サクラソウ科（APG：ヤブコウジ科） |
| ヤマアワ Calamagrostis epigeios （L.) Roth | イネ科 |
| ヤマザトタンポポ Taraxacum arakii Kitam. | キク科 |
| ヤマトウミヒルモ Halophila nipponica Uchimura&Fave | トチカガミ科 |
| ヤマトボシガラ Festuca japonica Makino | イネ科 |
| ヤマヒョウタンボク Lonicera mochidzukiana Makino var. nomurana （Makino) Nakai | スイカズラ科 |
