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高等植物
| 和名・学名 | 科 目 |
|---|---|
| コハナヤスリ Ophioglossum thermale Kom. var. nipponicum （Miyabe et Kudô) M.Nishida | ハナヤスリ科 |
| コバノウシノシッペイ Hemarthria compressa （L.f.) R.Br. | イネ科 |
| コバノチョウセンエノキ Celtis biondii Pamp. | ニレ科（APG：アサ科） |
| コヒロハハナヤスリ Ophioglossum petiolatum Hook. | ハナヤスリ科 |
| コフジウツギ Buddleja curviflora Hook. et Arn. | フジウツギ科（APG：ゴマノハグサ科） |
| コマツカサススキ Scirpus fuirenoides Maxim. | カヤツリグサ科 |
| コムラサキ Callicarpa dichotoma （Lour.) K.Koch | クマツヅラ科（APG：シソ科） |
| コメガヤ Melica nutans L. | イネ科 |
| コメツガ Tsuga diversifolia （Maxim.) Mast. | マツ科 |
| サイコクヌカボ Persicaria foliosa （H.Lindb.) Kitag. var. nikaii （Makino) H.Hara | タデ科 |
| サガミトリゲモ Najas chinensis N.Z.Wang | イバラモ科（APG：トチカガミ科） |
| ササユリ Lilium japonicum Houtt. | ユリ科 |
| サナギイチゴ Rubus pungens Camb. var. oldhamii （Miq.) Maxim. | バラ科 |
| サヤヌカグサ Leersia sayanuka Ohwi | イネ科 |
| サワオグルマ Tephroseris pierotii （Miq.) Holub | キク科 |
| シコクエビラフジ Vicia venosa （Willd. ex Link) Maxim. subsp. yamanakae （Y.Endo et H.Ohashi) Y.Endo et H.Ohashi | マメ科 |
| シコクギボウシ Hosta shikokiana N.Fujita | ユリ科（APG：リュウゼツラン科） |
| シコクザサ Sasa hayatae Makino var. hirtella （Nakai) Sad.Suzuki | イネ科 |
| シバスゲ Carex nervata Franch. et Sav. | カヤツリグサ科 |
| シモツケヌリトラノオ Asplenium boreale （Ohwi ex Sa.Kurata) Nakaike | チャセンシダ科 |
| ジュウニヒトエ Ajuga nipponensis Makino | シソ科 |
| シュスラン Goodyera velutina Maxim. | ラン科 |
| シラヒゲソウ Parnassia foliosa Hook.f. et Thomson var. foliosa | ユキノシタ科（APG：ウメバチソウ科） |
| シロネ Lycopus lucidus Turcz. ex Benth. | シソ科 |
| スギラン Huperzia cryptomerina （Maxim.) Dixit | ヒカゲノカズラ科 |
